Використання пестицидів має свої плюси і мінуси. Ключ до безпечного їх використання – правила внесення.

   По-перше, пестициди стараються застосовувати тільки тоді, коли без них не можна обійтися. Наприклад, чисельність шкідників така, що вони здатні повністю знищити врожай. Висока засміченість посівних культур знижує врожайність, викликає забруднення зерна насінням бур'янів, в результаті чого зерно стає непридатним для харчових і кормових цілей, а також знижується віддача від добрив, меліорації і інших заходів.

    По-друге, застосування кожного препарату суворо регламентується. І ці регламенти підлягають обов'язковому дотриманню. Перш за все вказується, на яких культурах дозволено використання даного препарату. Для кожного препарату вказується норма витрат, термін останньої обробки (часовий інтервал між останнім застосуванням препарату і збиранням врожаю, необхідний для розкладання пестициду до нетоксичних сполук), кратність застосування, час виходу на ручні і механізовані роботи. Ці параметри повинні чітко дотримуватися, щоб продукція була чистою та безпечною.

    Про безпеку продукції судять за величиною залишкових кількостей пестицидів в ній. Їх вміст не повинен перевищувати максимально допустимого рівня, який встановлюється медиками і вважається безпечним для здоров'я людини. Даний вміст регламентується законодавством України: Законами України «Про пестициди і агрохімікати», «Про захист рослин» та відомчими наказами, основними з яких є Державні санітарні правила Міністерства охорони здоров’я України «Транспортування, зберігання та застосування пестицидів у народному господарстві».

    Міністерством охорони здоров’я України затверджено «Гігієнічну класифікацію пестицидів за ступенем небезпеки» залежно від впливу на здоров’я людини, згідно з якою пестициди поділяються на чотири класи: I – надзвичайно небезпечні; ІІ – небезпечні; ІII – помірно небезпечні; IV – мало небезпечні. Токсичність вимірюється здатністю пестициду спричиняти подразнення або хворобу живого організму. Як правило, пестициди І класу небезпеки не рекомендуються для застосування в сільському господарстві. Обмежене застосування їх можливе у виняткових випадках (гостра потреба знищення шкідливих об'єктів). Цей виняток не поширюється на речовини, які мають канцерогенні або мутагенні властивості і застосування яких забороняється. Пестициди II класу небезпеки у разі необхідності можуть застосовуватися в господарствах тільки спеціалістами із захисту рослин або під їх контролем чи особами, що пройшли спеціальну фахову підготовку, за умов суворої регламентації застосування, яка гарантує їх безпеку для працівників, населення і навколишнього середовища. Роздрібна торгівля пестицидами II класу допускається лише особами, що пройшли спеціальну фахову підготовку. Пестициди III і IV класів небезпеки застосовуються відповідно до вимог чинних санітарних норм, правил, інструкцій та рекомендацій. При цьому для препаратів III класу небезпеки забороняється роздрібна торгівля в неспеціалізованих торгових місцях. Всі пестицидні препарати мають застосовуватися за умови обов'язкового дотримання Державних санітарних правил «Транспортування, зберігання та застосування пестицидів у народному господарстві».

    Менш небезпечними для людей є фунгіциди та гербіциди, більше – інсектициди. Гострий токсичний ефект від фунгіцидів для людей малоймовірний, але фунгіциди можуть подразнювати шкіру та очі, а систематичне опромінення може негативно вплинути на стан здоров'я людини. Частіше всього фунгіцидами отруюються після споживання насіння обробленої рослини. Тому до препарату додають фарбу, яка показує, що насіння оброблене.

    Гербіцидами отруїтись також важко. Але буває і таке. Частіше вплив гербіцидів на організм виражається у вигляді подразнень на шкірі, або подразнення дихальних шляхів, якщо препарат вдихнути. Частіше всього люди отруюються інсектицидами. Найнебезпечніші серед них – фосфорорганічні інсектициди, вони вражають нервову систему.

    Щоб звести до мінімуму негативний вплив отрутохімікатів на все живе, їх необхідно використовувати в мінімальних кількостях, зберігати в безпечному місці й суворо дотримуватися інструкції, а під час роботи з ними необхідно завжди одягати захисний костюм. По можливості, краще використовувати низькотоксичні пестициди.

    Альтернативними методами боротьби з бур'янами можуть бути попереджувальні заходи – очищення посівного матеріалу від насіння бур'янів, робота з органічними добривами, і винищувальні – механічне знищення бур'янів. Також сприятливо на виробництві позначається правильна сівозміна: своєчасні посіви і прибирання, посів проміжних культур, використання мінеральних добрив.

    Для боротьби з комахами-шкідниками альтернативою є біологічний метод. Він полягає в залученні природних ворогів шкідників – комах, птахів та інших тварин.